1994年，深圳红钻足球俱乐部由容志行、曾雪麟等人努力下在1月26日正式挂牌组建，是一家会员制职业足球俱乐部，是广东省最早成立的职业足球俱乐部之一，以“国内领先、亚洲一流、世界知名”为俱乐部的目标。球队成立当年在俱乐部首任主教练胡之刚的带领下，即获得乙级联赛冠军。
1995年，升入甲B联赛并获得当年冠军。
1996年，于成立第三年升入当时的中国足球顶级联赛甲A联赛，创造了中国足坛一支球队从成立到进入顶级联赛的最快纪录，凭借“三连跳”的表现创下了足球圈内的深圳速度。但球队于同年因战绩不佳重新降入甲B。 19年，平安保险集团全资收购深圳足球俱乐部，俱乐部冠名为深圳平安，获得甲B联赛亚军，重新得到甲A联赛晋级资格，从此一直留在顶级联赛中。
1998年，俱乐部聘请了亚洲足坛名宿、韩国人车范根担任主教练，车范根是俱乐部首位外籍主教练。1998年底收购火车头一线队22名队员中的14名队员，其中包括李玮锋及李毅、鲍文杰、杨光等人。
2000年，5月朱广沪接替巴西人塔瓦雷斯成为深圳足球队的主教练，获甲A联赛第九名。
2001年，在主教练朱广沪的带领下，球队获得了联赛第五名，在此后的数年间深圳足球队成为了中国足球联赛的强队之一。 2002年，获得了联赛亚军，这是球队在甲A时代的最佳成绩。12月，健力宝集团全资收购深圳足球俱乐部。
2003年，俱乐部更名为深圳健力宝足球俱乐部。拥有李玮锋、李毅、杨晨、郑智、郑斌等国脚，成为当时拥有现役国脚最多的球队，加上阵中多名外援国脚和本土实力球员，被球迷称作“健力宝”。
2004年夺得了首个联赛冠军，成为首支夺得顶级联赛冠军的广东省球队，并且获得了参加2005年亚洲冠军联赛的资格。由于2004年甲A联赛变身中国足球（简称“中超”），深圳队也成为了首届中超冠军。
2005年，球队财政状况不佳，再加上在队中地位颇高的主教练朱广沪被离开球队担当国家队主教练，引致队内一批主力球员出走，球队实力大受影响。结果在联赛中仅列第12名。即便处境艰难，球队依旧在杯赛中打出了坚韧不屈的深足精神，获得中超杯亚军，亚洲冠军联赛第三名，创造了深足神话。11月，健力宝集团转让深足90%的股权。 2006年，球队获一家深圳本地知名啤酒企业出资冠名为深圳足球俱乐部金威啤酒队，这个赛季聘请了王宝山担任主教练，开始以年青球员为主力，最终以第十一名完成中超。
2007年，球队获一家广州企业赞助，而更名为深圳香雪上清饮足球俱乐部，最终以第十四名完成中超。
2008年，深圳队几乎面临解散最终通过深圳市足协托管而保留下来，在首轮比赛中，深圳队客战上海申花，最终以0-2失利，在次轮4月1日次对阵广州医药的南粤德比比赛前，俱乐部宣布麦超下课，原领队张增群出任代理主帅。7月底请回了前主教练王宝山担任技术顾问，中超保级成功。另外，自深圳队创队后便一直使用的训练基地——笔架山基地要改造成2011年世界大会的训练场馆，基地被拆除重建，故深圳队也搬离这里。 2009年，红钻集团收购深足全部股份，成为第一支尝试实现自创品牌、自主经营的中国职业足球俱乐部。球队在联赛最后10轮取得的不败战绩，完成了保级。
2010年，前贝尔格莱德红星队主教练高歌奇与俱乐部正式签约，成为深足的主教练。5月15日，茅台集团正式成为主冠名商，球队冠名为深圳茅台红钻队。球队最终排名第12位保级成功。外援基伦14场进8球帮助深足完成保级，成为队内最佳射手，日夫科维奇则以10个助攻荣获中超助攻王。
2011年，外号“白巫师”的法国名帅特鲁西埃成为球队的主教练。球队签下了日本球员卷诚一郎和乐山孝志两名日本球员，中超联赛史上首次出现日本外援。主教练仓卒上任，球队在联赛一开始就五连败，因要让路大运会，深圳队要将大部分主场比赛迁到惠州和博罗体育中心进行,球队经常要在惠州和深圳两个城市往返。在大运会结束后，深圳队选择宝安体育场为球队的新主场。最终球队由于战绩不佳在顶级联赛屹立14年后首度降级。
2012年，深圳红钻自1996年以来第一次征战中国第二级别职业足球联赛。在赛季开始前，球队阵容结构出现较大幅度变动，因球队阵容变动较大，在2012年中甲联赛中，仅取得第七名的成绩，未能实现俱乐部赛季开始前制定的重返冲超目标。
2013年，深圳红钻队主场取得11胜2平2负的骄人战绩，外援巴巴卡表现出色，连续两年荣获最佳射手，球队最终排名第五。赛季末，小牛投资冠名深圳红钻，新赛季球队将以深圳小牛资本红钻队征战中甲联赛，与此同时，前国足队员李毅接替合约期满的特鲁西埃成为球队代理主教练。
2014年2月28日，深圳小牛资本红钻队宣布2014赛季转会一览，外援方面引进巴西前锋布鲁诺、意大利后卫朱塞佩，内援方面则引进高梵、韦键、王子华、陈国龙、牟善韬，以及从浙江绿城租借牛秀程。在球员转出方面，张世昌转会至广州富力，丁海峰和张天龙转会至辽宁宏运，陈柏良和罗希以自由球员身份转会上海申花，李佳奇转会至贵州智诚、耶和亚转会去了新疆博格达，迪力木拉提则前往西亚球队欧鲁巴效力，乐山孝志因合同到期宣布退役，加瓦农则自由转会离开。
2014年7月15日，2014中国足协杯第三轮，遭遇欠薪危机的深圳红钻在主场迎来山东鲁能的挑战，比赛中深足多人受伤离场，一度场上只有8人作战。比赛末端鲁能放弃进攻，但红钻仍以0-5惨败。
特鲁西埃，绰号“白巫师”。曾执教过的球队包括科特迪瓦ASEC阿比让俱乐部、科特迪瓦国家队、摩洛哥的Rabat队、尼日利亚国家队、布基纳法索国家队、南非国家队、日本国家队、卡塔尔国家队、法国马赛俱乐部，深圳茅台红钻足球俱乐部。
早年作为职业球员时的特鲁西埃并没有太大名气，他在20岁时获得了自己的第一份职业合同，1983年退役。退役后的他成为物理治疗师，并取得体育科学硕士学位。
1989年，他被科特迪瓦ASEC阿比让俱乐部聘为球队主教练，并率队三夺联赛冠军。卓越的战绩使特鲁西埃在1993年被科特迪瓦足协任命为科特迪瓦国家队主教练，并一直执教该队到1994年。
1995至19年，他来到摩洛哥的Rabat队执教。
19年，在率领尼日利亚队闯入世界杯决赛圈后，无奈被尼足协解雇。
1998年，他率布基纳法索队在1998年举行的非洲国家杯上，主场作战的布基纳法索获得了第四名的历史最佳成绩。
此后，他带领南非参加了1998年法国世界杯。
1998年9月，经温格介绍而成为日本国家队、国奥和国青队“三军”主帅。执教日本队后，特鲁西埃坚持向世界球队发起挑战，尽管他们经常惨败而归。特鲁西埃很快就发现日本队的症结所在，他认为日本足球缺少感性和。在挑选队员时，特鲁西埃既需要作风踏实稳定的球员，也需要有、疯狂的球员。
1999年4月，带领日本国青队获得世青赛亚军，当年的冠军是拥有卡西利亚斯、哈维和马切纳等球星的西班牙队。
2000年6月，带领日本队获得“麒麟杯”冠军。
2000年9月，带领日本国奥队获得悉尼奥运会第五名。
2000年10月，带领日本队获得亚洲杯冠军。
2001年5月，被亚足联评选为亚洲最佳教练，这是亚足联首次将年度最佳教练的称号颁给一名非亚洲籍的教练。
2001年6月，带领日本队获得2001联合会杯亚军，7月蝉联“麒麟杯”冠军。 2002年夏天，在韩日世界杯上带领日本队闯入16强，最终获得世界杯第9名。
2003年7月执教卡塔尔队，不敌印尼后黯然下课。
2004年11月执教马赛队，将球队从接手时的第10名带到第5名（与第四名同分）。
2010年开始在日本丙级联赛FC琉球队担当顾问。
2011年2月22日成为中超深圳茅台红钻队主教练。
2011年10月29日，深圳队2:3不敌山东鲁能泰山队，因主场变迁、俱乐部欠薪等，球队当年降级。
2012年2月，被评为“21世纪世界最佳教练”第53名。
2013年11月5日，特鲁西埃合同期满，离开深圳。
法国籍名帅特鲁西埃在离开中甲深圳红钻之后与马来西亚国足主帅等传出了绯闻，但相关谈判没有取得成功。2014年夏天，特鲁西埃与突尼斯联赛的斯法克斯俱乐部签约，成为这支球队的新任主教练，并带领球队杀进非洲冠军联赛四强。
2014年12月，成为中超杭州绿城队主教练。
2015年7月，特鲁西埃与俱乐部达成协议提前解约。
深圳足球俱乐部于1994年1月26日正式挂牌，是一家严格按照股份制运作的职业足球俱乐部。亦是继广州太阳神队后,广东省第二家成立的职业足球俱乐部。以“国内领先、亚洲一流、世界知名”为俱乐部的目标。
球队成立当年在俱乐部首任主教练胡之刚的带领下，即获得乙级联赛冠军，次年（1995年）升入甲B联赛并获得当年冠军，并于成立第三年（1996年）升入当时的中国足球顶级联赛甲A联赛，凭借“三连跳”创下了足球圈内的深圳速度。但球队于同年因战绩不佳重新降入甲B。
19赛季，征战获得甲B联赛亚军，重新得到晋级资格，从此一直留在顶级联赛中。
1998赛季，俱乐部聘请了亚洲足坛名宿、韩国人车范根担任主教练，在国内外引起强烈反响。当年以及第二年，球队均保级成功。
2000赛季，获全国足球甲A联赛第九名。
2001赛季，在主教练朱广沪的带领下，球队获得了联赛第五名，从此深圳足球队成为了中国足球联赛的强队之一。
2002赛季，球队获得了联赛半程冠军，是继大连实德、上海申花后第三支获得过联赛半程冠军的球队，并最终获得联赛亚军。
2003赛季，获得联赛第四名。
2004赛季，成为中国足球的始创球队,并在朱广沪带领下，球队夺得了自己的首个联赛冠军，成为第四支染指过顶级联赛冠军的球队及首支夺得顶级联赛冠军的广东省球队，并且和山东鲁能一起获得了参加2005年亚洲冠军联赛的资格。由于
2004年甲A联赛变身中国足球（简称中超），深圳队也成为了首届中超冠军。
2005年赛季，由于俱乐部前董事长张海经营不善，球队财政状况糟糕，再加上在队中地位颇高的主教练朱广沪被中国足协选中，离开球队担当国家队主教练，一批国脚和实力选手出走，球队实力大受影响。随后，迟尚斌担任主帅，但因为其与球队中的一些大佬球员（后迟与当时俱乐部总经理杨塞新将其称之为球霸）关系紧张，球队成绩差强人意，迟也被迫下课。而“球霸”也在社会上引起了很大震动，大多数人认为整个由那些霸王球员造成，影响恶劣。但也有部分人认为事情起因纯粹是队内新旧两派势力为争夺球队主导权而展开的斗争。在这一年内球队竟换了三位主教练,分别是:迟尚斌、郭瑞龙和王宝山(未计被中国足协选中，离开球队担当国家队主教练的朱广沪及两度暂代主教练一职的谢峰)，亚洲冠军联赛晋身半决赛，创造了中国球队的最佳成绩。
2006年赛季,球队更名为深圳足球俱乐部金威啤酒队及开始以年青球员为主力，最终以第十一名完成中超。
2007年赛季,球队获一家广州企业赞助，而更名为深圳香雪上清饮足球俱乐部，赞助费达到3000万人民币并应赞助商的要求将本赛季其中五场中超赛事移师到广州进行,但最后只将两场中超搬到广州的广东省人民体育场进行，最终以第十四名完成中超。
2008年赛季，在本赛季之前，深圳就几乎面临解散的危局，虽然最终得以托管而保留下来，在首轮比赛中，深圳客战上海申花，最终以0比2失利，由于实力方面的巨大差距而且是客场作战，这一并非不可接受，因此这仅仅可以称得上麦超下课的导火索，麦超已经创下了中超联赛以来的下课最早纪录，而此前一直空缺的主教练一职由领队张增群兼任，最终取得联赛第十二名。外，自深圳队创队后便一直使用的训练场——笔架山基地要改造成2011年世界大会的训练场馆，基地被拆除重建，故深圳队也搬离这里。
2009年赛季,17名球员集体罢训，在深圳市足球管理中心（深圳足协）索要薪水并要求上榜转会，最终只获得“白条”欠薪证明。 1月21日，深圳足球俱乐部正式宣布，香港一外资财团及深圳南山少年足球俱乐部将以收购深足全部股份的方式而成为深足新股东，俱乐部注册名称暂为深圳亚旅足球俱乐部。而深足两名前队员范育红、李远平分别出任俱乐部总经理兼主教练、助理教练及前主教练路建人出任领队、守门员教练及新闻发言人，2月时又邀请另一前主教练、甲A时期的人气教练塔瓦雷斯出任技术顾问兼执行教练，同时请来足坛元老、前国家队主教练曾雪麟重返深足，担任球队的总顾问共同组成新教练组并被视作深足历史上最弱的教练组。3月28日深穗之战后，深足总经理兼主教练范育红宣读了“关于深圳市足球俱乐部股权转让情况的说明”，表示杨塞新持有的全部股份，已在2月下旬正式转让给了香港润迅通信国际有限公司董事会丁鹏云和股东任德章 至此,闹得沸沸扬扬的深足股权转让水落石出。但在4月14日，丁鹏云发出《严正声明》表明他不是深足的投资人，深足再次陷入动荡。4月21日，广东健力宝集团持有的深足10%股权成功转让，标示 “健力宝”已完全退出深圳足球俱乐部。7月30日，深足俱乐部宣布主打产品为手机的诺亚信公司以买断球衣背后广告的方式而成为深足本赛季首个赞助商，结束半年­无赞助商的“裸奔”尴尬。 9月23日，深圳足球俱乐部正式宣布，由俱乐部股东发起成立的红钻公司将冠名球队为深圳红钻足球队，并且成为第一支尝试实现自创品牌、自主经营、自我冠名的中国职业足球俱乐部。深圳队在联赛间歇期从上海申花打包租借了毛剑卿、巴尔克斯、陈雷三名球员，并签约曾效力天津泰达被誉为津门铁卫的佐里奇，实力获得很大提升。在主场对上海申花的比赛错穿球衣因而被中国足协倒扣联赛积分3分的不利情况下，球队在联赛最后10轮取得6胜4平的不败战绩，完成了保级。 曾使用名称 1994-1995年 Shenzhen FC深圳足球俱乐部
1996年 Shenzhen Feiyada深圳飞亚达
19-98年 Shenzhen Ping'an深圳平安
1999年 Shenzhen Ping'an Insurance深圳平安保险
2000-01年 Shenzhen Ping'an Kejian深圳平安科健
2002年 Shenzhen Ping'an Insurance深圳平安保险
2003-05年 Shenzhen Jianlibao深圳健力宝
2006年 Shenzhen Kingway深圳金威
2007-09年 Shenzhen xiangxue EISITI 深圳上清饮
2009年-至今 Shenzhen Ruby深圳红钻
早在2005年，王洪亮就深的时任申花主帅涅波的赏识，并在申花6-1狂扫当时的沈阳金德的比赛中第一亮相中超。那一场比赛，王洪亮丝毫没有中超新人的紧张表现，在比赛中始终保持着活跃的状态，并在赛后得到了涅波的大力赞赏。而在那一年的上海滩德比中，同样替补登场的王洪亮攻入了比赛的最后一粒入球，帮助申花3-0战胜上海中邦。随后与鲁能的焦点战役里，他获得了在申花的第一次首发机会。整个05赛季，王洪亮一共7次登场，2次首发，总共出场230分钟，打入1粒入球。可以说，他在上海申花的第一个赛季是相当成功的。
接下来的3个赛季中，王洪亮每年都有十多次登场机会，虽然没有取得进球，可是他早已成为申花队的主力后腰。2008年，他更曾被涅波钦点，前往意甲豪门尤文图斯参加试训。在上海申花效力的3年中，王洪亮的职业生涯一片坦途。
可是，09赛季开始之前，作为前国奥队员，同时也是申花主力后腰之一的王洪亮，却被球队下放到了预备队。官方给出的原因是“末位淘汰制”。不过回到一线队后，王洪亮的重新赢得了贾秀全的信任，并在前11轮的比赛中获得了7次出场机会。
2011年上半年王洪亮回了一趟深圳，和红钻主帅特鲁西埃谈关于二次转会的事情，但被法国人婉转地拒绝了。王洪亮不怪特鲁西埃的“无情”，“有队友和我分析过，特鲁西埃现在对于俱乐部上层完全是一种抵触和逆反的心理，因为他觉得自己当初被骗了，而他又觉得我是领导找来的人，所以就偏不用，也不让我转会。”
“贾秀全还在的那一年，2009年吧，我被下放了七次。一年，七次，创纪录了。”身边的妻子贾丽听了也气愤不过，“反正只要出事，输了球，就是他。我觉得他踢的这个位置，根本不可能打球的，想不通。”
“第一次下放，我觉得自己有可能做错了。”王洪亮苦笑了一下，“等下放到第三次的时候我就知道，不是自己的问题，我是被人故意整了。”
“其实2010年年底就受伤了，是右腿的膝关节半月板，平时一直蛮疼的，但没当回事。过完年到深圳队去训练，练着练着就觉得不行了。一直拖拖拉拉的，到（2011年）4月份才开刀。等于到现在都没踢过球，处于失业状态。”
作为曾经入选过国家队的前国脚，王洪亮从来没有想到，自己会有这样一天——当昔日的队友们在训练场上挥汗如雨的时候，他却在小区旁边的羽毛球馆里挥汗如雨，然后回家洗把澡，带上妻子，坐在拥挤的避风塘柜台边的椅子上，一边用菜单扇着汗，一边等着服务员叫号入座。
“沈龙元一直和我说，要是相同的事情发生在他身上，他肯定就崩溃了。我觉得，真的，我已经很坚强很坚强了。”这半年，因为受伤，王洪亮没有球踢，没有俱乐部呆，这半年里，他甚至没有一分钱的收入。
后王洪亮加盟深圳红钻，找到自己。然而15年，遭遇欠薪，他决定结束自己的运动生涯。
1994年1月26日，深圳足球俱乐部在容志行、曾雪麟等人努力下正式挂牌组建，是一家会员制职业足球俱乐部，是广东省最早成立的职业足球俱乐部之一，以“国内领先、亚洲一流、世界知名”为俱乐部的目标。球队成立当年在俱乐部首任主教练胡之刚的带领下，即获得乙级联赛冠军。
1995年，升入中国足球甲B联赛并获得当年冠军。
1996年，于成立第三年升入当时的中国足球顶级联赛即中国足球甲A联赛，创造了中国足坛一支球队从成立到进入顶级联赛的最快纪录，凭借“三连跳”的表现创下了足球圈内的深圳速度。但球队于同年因战绩不佳重新降入甲B。 19年，平安保险集团全资收购深圳足球俱乐部，俱乐部冠名为深圳平安，获得甲B联赛亚军，重新得到甲A联赛晋级资格，从此一直留在顶级联赛中。1998年，俱乐部聘请了亚洲足坛名宿、韩国人车范根
担任主教练，车范根是俱乐部首位外籍主教练。1998年底收购火车头一线队22名队员中的14名队员，其中包括李玮锋及李毅、鲍文杰、杨光等人。
2000年，5月朱广沪接替巴西人塔瓦雷斯成为深圳足球队的主教练，获甲A联赛第九名。
2001年，在主教练朱广沪的带领下，球队获得了联赛第五名，在此后的数年间深圳足球队成为了中国足球联赛的强队之一。 2002年，获得了联赛亚军，这是球队在甲A时代的最佳成绩。12月，健力宝集团全资收购深圳足球俱乐部。
2003年，俱乐部更名为深圳健力宝足球俱乐部。拥有李玮锋、李毅、杨晨、郑智、郑斌等国脚，成为当时拥有现役国脚最多的球队，加上阵中多名外援国脚和本土实力球员，被球迷称作“健力宝”。
2004年夺得了首个联赛冠军，成为首支夺得顶级联赛冠军的广东省球队，并且获得了参加2005年亚洲冠军联赛的资格。由于2004年甲A联赛变身中国足球（简称“中超”），深圳队也成为了首届中超冠军。
2005年，球队财政状况不佳，再加上在队中地位颇高的主教练朱广沪被迫离开球队担当国家队主教练，引致队内一批主力球员出走，球队实力大受影响。结果在联赛中仅列第12名。即便处境艰难，球队依旧在杯赛中打出了坚韧不屈的深足精神，获得中超杯亚军，亚洲冠军联赛第三名，创造了深足神话。11月，健力宝集团转让深足90%的股权。 2006年，球队获一家深圳本地知名啤酒企业出资冠名为深圳足球俱乐部金威啤酒队，这个赛季聘请了王宝山担任主教练，开始以年青球员为主力，最终以第十一名完成中超。
2007年，球队获一家广州企业赞助，而更名为深圳香雪上清饮足球俱乐部，最终以第十四名完成中超。
2008年，深圳队几乎面临解散最终通过深圳市足协托管而保留下来，在首轮比赛中，深圳队客战上海申花，最终以0-2失利，在次轮4月1日次对阵广州医药的南粤德比比赛前，俱乐部宣布麦超下课，原领队张增群出任代理主帅。7月底请回了前主教练王宝山担任技术顾问，中超保级成功。另外，自深圳队创队后便一直使用的训练基地——笔架山基地要改造成2011年世界大会的训练场馆，基地被拆除重建，故深圳队也搬离这里。 2009年，17名球员集体罢训，在深圳市足球管理中心（深圳足协）索要薪水并要求上榜转会，最终只获得“白条”欠薪证明。 1月21日，深圳足球俱乐部正式宣布，香港一外资财团及深圳南山少年足球俱乐部将以收购深足全部股份的方式而成为深足新股东，俱乐部注册名称暂为深圳亚旅足球俱乐部。而深足两名前队员范育红、李远平分别出任俱乐部总经理兼主教练、助理教练及前主教练路建人出任领队、守门员教练及新闻发言人，2月时又邀请另一前主教练、甲A时期的人气教练塔瓦雷斯出任技术顾问兼执行教练，同时请来足坛元老、前国家队主教练曾雪麟重返深足，担任球队的总顾问共同组成新教练组并被视作深足历史上最弱的教练组。3月28日深穗之战后，深足总经理兼主教练范育红宣读了“关于深圳市足球俱乐部股权转让情况的说明”，表示杨塞新持有的全部股份，已在2月下旬正式转让给了香港润迅通信国际有限公司董事会丁鹏云和股东任德章 至此,闹得沸沸扬扬的深足股权转让水落石出。但在4月14日，丁鹏云发出《严正声明》表明他不是深足的投资人，深足再次陷入动荡。4月21日，广东健力宝集团持有的深足10%股权成功转让，标示 “健力宝”已完全退出深圳足球俱乐部。7月30日，深足俱乐部宣布主打产品为手机的诺亚信公司以买断球衣背后广告的方式而成为深足本赛季首个赞助商，结束半年无赞助商的“裸奔”尴尬。 9月23日，深圳足球俱乐部正式宣布，由俱乐部股东发起成立的红钻公司将冠名球队为深圳红钻足球队，并且成为第一支尝试实现自创品牌、自主经营、自我冠名的中国职业足球俱乐部。深圳队在联赛间歇期从上海申花打包租借了毛剑卿、巴尔克斯、陈雷三名球员，并签约曾效力天津泰达被誉为津门铁卫的佐里奇，实力获得很大提升。在主场对上海申花的比赛错穿球衣因而被中国足协倒扣联赛积分3分的不利情况下，球队在联赛最后10轮取得6胜4平的不败战绩，完成了保级。
2010年，前贝尔格莱德红星队主教练高歌奇与俱乐部正式签约，成为深足的主教练。5月15日，茅台集团正式成为主冠名商，球队冠名为深圳茅台红钻队。球队最终排名第12位保级成功。外援基伦14场进8球帮助深足完成保级，成为队内最佳射手，日夫科维奇则以10个助攻荣获中超助攻王。
2011年，外号“白巫师”的法国名帅特鲁西埃成为球队的主教练。球队签下了日本球员卷诚一郎和乐山孝志两名日本球员，中超联赛史上首次出现日本外援。主教练仓卒上任，球队在联赛一开始就五连败，因要让路大运会，深圳队要将大部分主场比赛迁到惠州和博罗体育中心进行,球队经常要在惠州和深圳两个城市往返。在大运会结束后，深圳队选择宝安体育场为球队的新主场。最终球队由于战绩不佳在顶级联赛屹立14年后首度降级。
2012年，深圳红钻自1996年以来第一次征战中国第二级别职业足球联赛。在赛季开始前，球队阵容结构出现较大幅度变动，因球队阵容变动较大，在2012年中甲联赛中，仅取得第七名的成绩，未能实现俱乐部赛季开始前制定的重返冲超目标。
2013年，深圳红钻队主场取得11胜2平2负的骄人战绩，外援巴巴卡表现出色，连续两年荣获最佳射手，球队最终排名第五。赛季末，小牛投资冠名深圳红钻，新赛季球队将以深圳小牛资本红钻队征战中甲联赛，与此同时，前国足队员李毅接替合约期满的特鲁西埃成为球队代理主教练。
2014年，深足在世界杯休战期前半年尚且稳扎稳打，尽管俱乐部累积的拖欠薪水和奖金问题逐渐恶化，并深陷转让传闻中，但仍取得了中上排名并非全无冲超希望。但俱乐部的转让进程由于以往累积的股权乱局和万宏伟要求保留少部分股份的条件，从5月起就开展却难以成交，从而使得球员和俱乐部间的欠薪矛盾在随后以一种极端的形式爆发。 2014年7月15日，深圳红钻在主场深圳宝安体育场进行的中国足协杯第三轮赛事以0-5惨败山东鲁能，但是赛事焦点却集中在了深圳红钻队员赛前讨薪上。队员们赛前就因被欠薪而放弃本场比赛，经各方一番紧急沟通后，深足队员同意参赛，但球员仍以特殊方式表达对欠薪的不满。在本场比赛开始前，深足队员们举起上面写道“请求足协帮助，球员生活已无法维持，还我血汗钱”的横幅。在裁判吹响开赛哨后，深足队员们面向本方的球门默站了足足30秒，以示对俱乐部长期拖欠薪酬的***，事后迅速在全国引起热议。足协也立刻发出工作组到深圳调查并维稳，尽管作出了再不解决欠薪就会遭到扣分以及乃至明年不准予注册参赛的警告，但仍无助于解开俱乐部本身积重难返的结。在代表其中一家竞购方新到任的副总，亦是深足的老面孔孙刚和教练组的努力下，只能偶然收到俱乐部通过***等预支手段筹发的基本薪水的球员没有再出现通过集体罢训罢赛***的情况，但球队在时常遭遇外援因欠薪拒绝出赛的困难上难保成绩理想，不过仍实现了提前保级并尽量攒分以预防足协可能作出的扣分出发，最终以第十名结束了一个场上偶有亮点，场下却行走于解散边缘的困难赛季。
2014年12月19日，俱乐部召开记者招待会宣布深圳兆能源酒店供应股份有限公司通过注资的方式获得俱乐部55%的股权并成为新控股方。同时，俱乐部名称改为中性的深圳足球俱乐部。
2015年12月13日，深圳足球俱乐部召开新闻发布会，宣布俱乐部新任主教练人选确定为本土名帅唐尧东。 2015年中甲联赛深圳市足球俱乐部宇恒队球员名单 序号姓名号码出生日期身高(cm)体重(Kg)场上位置籍贯/国籍1牛犇11989-3-1118575守门员陕西省2耿晓顺21990-5-1718675后卫辽宁省4刘帅41989-4-217875前卫安徽省5任鹏51987-1-3018880后卫辽宁省6凌思浩61991-2-217569前卫河南省7黄隆71981-1-1318473前卫广东省8杜龙泉81988-5-2918179后卫辽宁省10巴巴卡101986-3-218680前锋法国11桑戈尔111986-1-2818867前锋塞内加尔12韦健121991-1-619080守门员贵州省13于乐131985-2-2618477前锋北京市15吕政151989-5-1518270后卫山东省16孙正傲161994-3-818358前卫山东省17牟善韬171990-3-117666前卫辽宁省18吴伟安181981-9-118171前卫广东省20费煜201991-2-618780前卫上海21蔡镜源211987-1-117067前卫广东省22谭宾凉221989-11-417575前卫广东省23刘徳慰231991-12-117167前锋广东省24朱塞佩241983-5-2118780后卫意大利25赖劲251991-2-117060前卫广东省26王伟龙261988-2-2418781后卫山东省27张271989-1-617775前卫吉林省28于帅281989-6-28185前锋山东省29邱柯焙291993-2-2818673守门员广东省31黎斐311983-2-1717468前卫湖北省32张宏楠321991-1-1718268前卫辽宁省33黄新331991-5-2218068后卫辽宁省39金泳厚391983-3-11 18381 前锋韩国
中超联赛冠军排行榜是山东泰山（冠军）、上海海港（亚军）、广州队（季军）、长春亚泰、北京国安、深圳队、广州城、河北队、上海申花、河南嵩山龙门、沧州雄狮、天津津门虎、武汉队、重庆两江竞技、大连人、青岛队。冠军：山东泰山。山东泰山此提前3轮夺冠，本赛季他们的战绩是15胜6平1负，展现出了超强的统治力。泰山队是中超所有球队外援最齐整、不欠薪、阵容合理的球队，一整个赛季的表现都非常强势。孙浩准、刘彬彬、郭田雨、费莱尼等人的表现都非常出色，最终在主帅郝伟的带领下，球队成功拿下本赛季中超冠军，也是队史第5个联赛冠军，时隔11年后再度站上中超之巅。第2-4名：上海海港（亚军）、广州队（季军）、长春亚泰。在中超最后一轮之前，广州队还领先海港2分，末轮两队直接接受，广州队不输球就可以确保本赛季中超亚军。比赛中刘祝润的进球让海港取得领先，并且最终拿下胜利，张琳芃压哨踢丢点球。这样本赛季的中超亚军归属在最后一战才有了结果，上海海港拿下第二名，广州队斩获季军。长春亚泰本赛季排名第4，他们的表现非常出色，作为升班马可以取得联赛殿军，令人眼前一亮，儒尼奥尔-内格拉还斩获了联赛金靴。第5-8名：北京国安、深圳队、广州城、河北队。北京国安末轮击败深圳队，成功拿下中超第5名，也是压哨反超深圳队，本赛季的国安实力不俗，但可惜的是外援的集体离开、受伤对于球队的影响是很大的。深圳队最终被国安反超，排名中超第6名。广州城末***胜河北队，也成功狙击了希望反扑的对手，斩获本赛季中超第7名。第8名属于河北队，他们队内的困难也是有目共睹。第9-12名：上海申花、河南嵩山龙门、沧州雄狮、天津津门虎。上海申花斩获保级组第一名，事实上这个排名对于他们来说并不意外，整体的实力是有冲击争冠组的，但可惜此前功亏一篑，如今申花拿下了中超第9名。河南队最终排名第10，这个赛季他们来说是非常不容易，取得这样的成绩，实现保级完成目标。沧州雄狮在保级组只输了2场比赛，提前完成任务，表现强势，未来可期。天津津门虎依靠着最后一场比赛谢维军的进球，才惊险保级成功，最终排名中超第12名。第13-16名：武汉队、重庆两江竞技、大连人、青岛队。武汉队末轮逆转取得胜利，惊险保级，非常不容易。重庆两江竞技本赛季最令人印象深刻的是主帅张外龙掉眼泪，保级大战前后，他非常激动，也很感动人。大连人在最后一轮取得4-1的大胜，依旧不能直接保级，他们接下来要参加附加赛，对手是成都蓉城。青岛队是提前锁定了本赛季中超垫底的位置，他们接下来的对手是浙江队，想要保级，必须要全力以赴。
毫无疑问，这一举措将有助于中超竞赛组织的协调工作，而且也是中国足球管办分离再度向前推进的重要一步。
管办分离突成焦点
据了解，在中超公司接管完成之后，这三项赛事的竞赛事务将由中超公司全部接手。这样一来，中超公司和执行局将各负其责：中超公司负责竞赛组织、场地安排、赛程编排、俱乐部管理等事项，执行局则负责上述赛事的监管、注册和准入。
马成全表示：“这是中国足球管办分离深入发展的一步，可以让中超更协调、更顺畅。今后，赛事、电视转播、经营开发都由中超公司统一协调管理，操作层面顺多了，这样还可以让赞助商的利益得到更大保障。”
另外，中甲整体商务开发也出现突破进展。在当日分组工作会议中甲组讨论中，中国足协表示下赛季将启动中甲整体商务开发。
实际上，管办分离并非是此次会议的主要议题，但这一变化还是成为了与会者最为关心的话题。
中超公司全面接管中超竞赛组织工作，意味着足协今后不再以“管理者”的身份兼任“办联赛人”的角色，而将联赛的经营、管理权下放给全新的中超公司，足协今后更多的是行使监管职能。
当然，中国足协推动管办分离也已经很长时间。实际上，就连职业联赛理事会执行局本身也是管办分离的一个产物，但其职能与当时的职业联赛部的职能存在一定重叠。虽然后来中国足协取消了职业联赛部，但执行局与中超公司之间在运营和商务开发上，仍然有界定不清的地带。
早在2012年，中超联赛就曾短暂归于中超公司进行管理，但这一改革仅仅持续了几个月，最终夭折。
值得一提的是，今年8月，国家体育总局足球运动管理中心副主任于洪臣从中超公司董事长位置上卸任，足管中心领导不再任企业领导，为中超公司接管中超联赛铺平了道路。
推进仍需循序渐进
不过，足球运动管理中心职业发展与监管部主任刘殿秋在接受访时也称“管办分离”要循序渐进，不可能指望在一个赛季就完全实现。足管中心副主任于洪臣表示中超联赛“管办分离”目前还未获得国家体育总局的批准，如果能够在新赛季中实行，那也将以“职能调整、结构改造”为主。
在现实情况之下，管办分离不可能一蹴而就，这也成为了与会俱乐部代表的一致意见。
杭州绿城俱乐部副总经理鲍仲良认为，“管办分离”体现了足协改革职业联赛的决心，在足协提出这一想法时，还与各俱乐部进行了充分沟通。他说这种减少行政干预、尊重市场规律的思路很好。但他同时表示“管办分离”在短期内很难完全实现，需要逐步进行。
而北京国安俱乐部副董事长张路则表示“管办分离”要慎重。他说举办中超联赛的“社会性”很强，在很大程度上要靠来协调，并且需要方方面面的配合。“管办分离”之后，只靠一个中超公司的力量办联赛“有些困难”。
张路说，现在各地方中超联赛的组委会是由各省市足协牵头，代表做好安保、公共交通等各方面的协调工作。而没有了的协调，中超公司相当于管理层级降低，这样运行的成本会很高。
中国足协将严格联赛准入，严惩欠薪严打阴阳合同
“欠薪者将无法参加联赛”
自从张剑成为中国足协常务副以来，他一直表现得非常低调。不过，在21日举行的2014年中国足协职业联赛总结会上，张剑终于在自己熟悉的法务规章领域祭出重拳——中国足协下赛季将严格联赛准入、严惩欠薪行为、严打阴阳合同，违规者甚至将付出无法参加联赛的代价。
张剑表示，“欠薪、俱乐部收支失衡等问题，影响了联赛的发展。联赛公平稳定的环境不仅包括比赛环境，还包括财务和制度的公平建设，此前中国足协的确对俱乐部的财务要求和审查不严，一些常年欠薪的俱乐部还能通过联赛准入。一些俱乐部不计回报地投入致使联赛资金投入量增幅很大，俱乐部自身价值却得不到理性体现，职业联赛遵循市场规律，但俱乐部一些行为没有按照市场规律进行运作。中国足协没有有效维护各俱乐部间的公平环境，没有取切实的手段和措施。职业联赛发展到新的阶段，依法规范更加重要。”
欠薪如今在中超、中甲俱乐部中，可以说并不是什么新鲜事。外界知道的可能有中超的大连阿尔滨、中甲的深圳红钻、中乙的山东滕鼎，但如果说到拖欠奖金和赢球奖的，可能就更加多，覆盖范围也更加广。
张剑说，足协不会再像以往瞻前顾后，而是将严格地执行一刀切的准入制度。如果有俱乐部因为欠薪无法完成注册，别的符合资格的俱乐部可以顶替，甚至不惜付出联赛减容的代价。“因为欠薪有一两个球队进不来了，联赛不好打了，那又怎样呢？如果都违反，那就都处罚，有什么不行的？”
除此之外，由于在这一年中，出现了青岛中能和刘健的合同***，这也让足协在合同管理方面痛定思痛。张剑说，中国足协过去的合同管理不完善，带来俱乐部和运动员合同签署不规范，甚至有阴阳合同、虚合同。“我们要下决心对中国职业球员的合同进行一次清理，甚至请国家相关部门帮助进行清理。”张剑说。
力帆未向足协提退出中超
若正式退出阿尔滨毅腾有望替补
重庆力帆退出中超一事仍然未有最终定论。不过，中国足协内部人士称，力帆并未向足协提出退出中超事宜。
之前有传言称力帆已向中国足协提交退出中超申请，但足协内部人士予以否认，并表示，按照程序，力帆即便不愿涉足中超，首先考虑的也应该是转让，转让不成才有可能退出。
据记者了解，力帆的首选还是将球队转让，目前融创中国是最接近的买主。不过，力帆的喊价是1.5亿元，而且不包括洋河基地，而融创中国的出价仅在1亿左右，双方还存在较大的分歧。而且，力帆队的条件中还包括球队不能迁出重庆，因此转让还不会在短时间内达成。
从目前的情况来看，尹明善去年对球队的投入，并非是对继续投资中国足球存在多大的热情，只不过是因为中超壳要比中甲壳更值钱。广东日之泉队转让到陕西的价格在3000万元左右，而力帆的中超壳叫价1.5亿元，两者之间的差距显而易见。
按照此前的先例，大连实德放弃2013赛季中超资格，而以2012赛季中超倒数第二名身份降入中甲的上海申鑫重返中超，参加了2013赛季中超联赛。因此如果重庆力帆未能转卖，并选择放弃中超资格，则今年以中超倒数第二名身份降入中甲的大连阿尔滨有望重返中超，只不过，大连阿尔滨目前欠薪缠身，能否完成新赛季联赛注册、通过准入，也还是个未知数。
如果阿尔滨无法通过准入，那么中超资格将顺延给去年中超积分垫底的哈尔滨毅腾队。不过从目前的情况来看，力帆应该不会选择直接退出的方式。
记者观察
管办分离再难也要前行
关于中国足球的管办分离，说来是句老话。在外人眼中，“管办分离”这四个字，不过是个“狼来了”的故事——说得久了，也就没人信了。
不过，从中超联赛改由中超公司运营，以及此前于洪臣卸任中超公司董事长的举动来看，中国足协确实有推动管办分离的决心，而且他们也的的确确在做着相关的事情。
作为中国足球的决策者，他们应该早已明白，像足球这样高度市场化的体育项目，想要跟上国际潮流的脚步，就必须按照职业体育项目规律办事。
深圳足球俱乐部于1994年1月26日正式挂牌，是一家严格按照股份制运作的职业足球俱乐部。亦是继广州太阳神队后,广东省第二家成立的职业足球俱乐部。以“国内领先、亚洲一流、世界知名”为俱乐部的目标。
球队成立当年在俱乐部首任主教练胡之刚的带领下，即获得乙级联赛冠军，次年（1995年）升入甲B联赛并获得当年冠军，并于成立第三年（1996年）升入当时的中国足球顶级联赛甲A联赛，凭借“三连跳”创下了足球圈内的深圳速度。但球队于同年因战绩不佳重新降入甲B。
19赛季，征战获得甲B联赛亚军，重新得到晋级资格，从此一直留在顶级联赛中。
1998赛季，俱乐部聘请了亚洲足坛名宿、韩国人车范根担任主教练，在国内外引起强烈反响。当年以及第二年，球队均保级成功。
2000赛季，获全国足球甲A联赛第九名。
2001赛季，在主教练朱广沪的带领下，球队获得了联赛第五名，从此深圳足球队成为了中国足球联赛的强队之一。
2002赛季，球队获得了联赛半程冠军，是继大连实德、上海申花后第三支获得过联赛半程冠军的球队，并最终获得联赛亚军。
2003赛季，获得联赛第四名。
2004赛季，成为中国足球的始创球队,并在朱广沪带领下，球队夺得了自己的首个联赛冠军，成为第四支染指过顶级联赛冠军的球队及首支夺得顶级联赛冠军的广东省球队，并且和山东鲁能一起获得了参加2005年亚洲冠军联赛的资格。由于
2004年甲A联赛变身中国足球（简称中超），深圳队也成为了首届中超冠军。
2005年赛季，由于俱乐部前董事长张海经营不善，球队财政状况糟糕，再加上在队中地位颇高的主教练朱广沪被中国足协选中，离开球队担当国家队主教练，一批国脚和实力选手出走，球队实力大受影响。随后，迟尚斌担任主帅，但因为其与球队中的一些大佬球员（后迟与当时俱乐部总经理杨塞新将其称之为球霸）关系紧张，球队成绩差强人意，迟也被迫下课。而“球霸”也在社会上引起了很大震动，大多数人认为整个由那些霸王球员造成，影响恶劣。但也有部分人认为事情起因纯粹是队内新旧两派势力为争夺球队主导权而展开的斗争。在这一年内球队竟换了三位主教练,分别是:迟尚斌、郭瑞龙和王宝山(未计被中国足协选中，离开球队担当国家队主教练的朱广沪及两度暂代主教练一职的谢峰)，亚洲冠军联赛晋身半决赛，创造了中国球队的最佳成绩。
2006年赛季,球队更名为深圳足球俱乐部金威啤酒队及开始以年青球员为主力，最终以第十一名完成中超。
2007年赛季,球队获一家广州企业赞助，而更名为深圳香雪上清饮足球俱乐部，最终以第十四名完成中超。
2008年赛季，深圳就几乎面临解散的危局，虽然最终得以托管而保留下来，在首轮比赛中，深圳客战上海申花，最终以0比2失利，由于实力方面的巨大差距而且是客场作战，这一并非不可接受，因此这仅仅可以称得上麦超下课的导火索，麦超已经创下了中超联赛以来的下课最早纪录，而此前一直空缺的主教练一职由领队张增群兼任，最终取得联赛第十二名。外，自深圳队创队后便一直使用的训练场——笔架山基地要改造成2011年世界大会的训练场馆，基地被拆除重建，故深圳队也搬离这里。
2009年赛季,17名球员集体罢训，在深圳市足球管理中心（深圳足协）索要薪水并要求上榜转会，最终只获得“白条”欠薪证明。 1月21日，深圳足球俱乐部正式宣布，香港一外资财团及深圳南山少年足球俱乐部将以收购深足全部股份的方式而成为深足新股东，俱乐部注册名称暂为深圳亚旅足球俱乐部。而深足两名前队员范育红、李远平分别出任俱乐部总经理兼主教练、助理教练及前主教练路建人出任领队、守门员教练及新闻发言人，2月时又邀请另一前主教练、甲A时期的人气教练塔瓦雷斯出任技术顾问兼执行教练，同时请来足坛元老、前国家队主教练曾雪麟重返深足，担任球队的总顾问共同组成新教练组并被视作深足历史上最弱的教练组。3月28日深穗之战后，深足总经理兼主教练范育红宣读了“关于深圳市足球俱乐部股权转让情况的说明”，表示杨塞新持有的全部股份，已在2月下旬正式转让给了香港润迅通信国际有限公司董事会丁鹏云和股东任德章 至此,闹得沸沸扬扬的深足股权转让水落石出。但在4月14日，丁鹏云发出《严正声明》表明他不是深足的投资人，深足再次陷入动荡。4月21日，广东健力宝集团持有的深足10%股权成功转让，标示 “健力宝”已完全退出深圳足球俱乐部。7月30日，深足俱乐部宣布主打产品为手机的诺亚信公司以买断球衣背后广告的方式而成为深足本赛季首个赞助商，结束半年­无赞助商的“裸奔”尴尬。 9月23日，深圳足球俱乐部正式宣布，由俱乐部股东发起成立的红钻公司将冠名球队为深圳红钻足球队，并且成为第一支尝试实现自创品牌、自主经营、自我冠名的中国职业足球俱乐部。深圳队在联赛间歇期从上海申花打包租借了毛剑卿、巴尔克斯、陈雷三名球员，并签约曾效力天津泰达被誉为津门铁卫的佐里奇，实力获得很大提升。在主场对上海申花的比赛错穿球衣因而被中国足协倒扣联赛积分3分的不利情况下，球队在联赛最后10轮取得6胜4平的不败战绩，完成了保级。
深圳足球俱乐部由容志行、曾雪麟等人努力下在1994年1月26日正式挂牌组建，是一家会员制职业足球俱乐部，规模为12名团体常任会员、100名团体会员和300名个人会员。但后来转为股份制职业足球俱乐部，是广东省最早成立的职业足球俱乐部之一，以“国内领先、亚洲一流、世界知名”为俱乐部的目标。
球队成立首年在首任主教练胡之刚的带领下，获得乙级联赛冠军，次年（1995年）升入甲B联赛并获得当年冠军，并于成立第三年（1996年）升入当时的中国足球顶级联赛甲A联赛，率先创造了中国足坛一支球队从成立到进入顶级联赛的最快纪录，凭借“三连跳”的表现创下了足球圈内的深圳速度。但球队于同年因战绩不佳重新降入甲B。
19年1月，平安保险集团全资收购深圳足球俱乐部，三年会员制时期终结。俱乐部冠名为深圳平安，获得甲B联赛亚军，重新得到甲A联赛晋级资格。
1998年，在经历了前半赛季的的帅位更迭后，亚洲足坛名宿、韩国人车范根在赛季半程从韩国国家队卸任加盟担任主教练，车范根亦是俱乐部首位外籍主教练。1998年底深圳足球俱乐部收购当时火车头一线队队员，其中包括此前已在深圳队踢了半年联赛的李玮锋及李毅、鲍文杰、杨光等人。1999年，车范根再度率队保级成功，帮助深圳队在顶级联赛立足。
2000年，巴西人塔瓦雷斯因“平安六君子”下课，领队朱广沪接替成为深圳足球队的主教练，甲A联赛获第九名。
2001年，在主教练朱广沪的带领下，球队获得了联赛第五名，在此后的数年间深圳足球队开始成为中国足球联赛的强队之一。
2002年，球队开始在甲A联赛中崭露头角，获得了联赛半程冠军，是继大连实德、上海申花后第三支获得过联赛半程冠军的球队，并最终以牌抽签方式获得联赛亚军，这是球队在甲A联赛的最佳成绩。12月，广东健力宝集团从平安保险集团全资收购深圳足球俱乐部。
2003年，深圳足球俱乐部也更名为深圳健力宝足球俱乐部，最终获得联赛第四名。这段时间球队实力有了长足进步，拥有李玮锋、李毅、杨晨、郑智、郑斌等国脚，成为当时拥有现役国脚最多的甲A球队，再加上阵中多名外援国脚和本土实力派球员，球队开始被球迷称作“健力宝”。
2004年，深圳健力宝成为中国足球的创始球队，并在朱广沪带领下，球队在七个月未发工资和奖金的情况下夺得了自己的首个联赛冠军，成为第四支染指过顶级联赛冠军的球队及首支夺得顶级联赛冠军的广东省球队，并且和山东鲁能一起获得了参加2005年亚洲冠军联赛的资格。由于2004年甲A联赛变身中国足球（简称“中超”），深圳队也成为了首届中超冠军。
2005年，深圳队在亚足联冠军联赛一举杀进最后四强，但半决赛两回合总0-6败给了当届亚军艾恩而无缘决赛。但由于俱乐部资金紧张，经营不善，球队财政状况糟糕，再加上在队中地位颇高的主教练朱广沪被中国足协选中，离开球队担当国家队主教练，引致队内一批国脚和实力选手出走，球队实力大受影响。随后，迟尚斌担任主帅，欲从严治军，却与球队中的一些“大哥大”球员（后迟与当时俱乐部总经理杨塞新将其称之为“球霸”）关系紧张，球队成绩差强人意，迟也被迫下课。在这一年内球队竟换了三位主教练分别是迟尚斌、郭瑞龙和谢峰，结果在中超联赛26场比赛只有4场赢球，在14支球队中仅列第12名，成为中国足球职业化12年来成绩最差的卫冕冠军。尽管有种种困难，球队在中超杯获得亚军及亚洲冠军联赛还是晋身半决赛，创造了不错的成绩。进入亚冠四强也是中超联赛成立以来亚冠成绩最好记录保持者。11月，广东健力宝集团转让深足90%的股权给汇中天桓财团，并继续拥有深足的10%股权。此后，深足的股东多次发生变动，最终由与澳门有关联的“港商”杨塞新成为大股东，但是健力宝集团始终直接持有深足的10%股份。
2006年，球队获一家深圳本地知名啤酒企业出资冠名，而冠名为深圳足球俱乐部金威啤酒队，这个赛季聘请了在广东足坛颇有渊源的王宝山担任主教练，但无奈于实力派球员纷纷被出走，最终仅以第十一名完成中超。
2007年，球队获一家广州企业赞助，而冠名为深圳香雪上清饮足球俱乐部，并为了赞助商的要求将其中五场中超赛事移师到广州进行，但最后只将两场中超搬到广州的广东省人民体育场进行，最终张军率自己由梯队一路带起的年轻球员以薄弱的阵容获得第十四名完成赛季，成功保级留在中超。但赛季结束后，号称对球队成绩和表现极度不满的投资人杨塞新宣布出让深圳队，不再投入。
2008年，在赛季开始之前，深圳队就几乎面临无人接手濒临解散的危局，最终通过深圳市足协托管而保留下来。在首轮比赛后，深圳队客战上海申花失利，随后深足俱乐部宣布麦超因广州足协召回而下课，创下了中超联赛以来主教练下课最早纪录。原领队及梯队教练张增群接任主教练一职，前主教练王宝山随后加盟担任技术顾问。得益于武汉光谷退赛，并凭借当季并列联赛金靴安哥拉外援约翰森和半程加盟的老将宋黎辉后半程的爆发，艰难地在中超再度保级成功。赛季结束后，自深圳队建队后便一直使用的训练基地——笔架山基地，由于要改造成2011年世界大会的训练场馆，被拆除重建，故深圳队也不得不搬离这里，开始了没有固定训练基地的流浪时期。
2009年，以万宏伟为代表的财团及建队元老球员范育红的深圳南山少年足球俱乐部正式宣布收购深足全部股份，成为深足新股东，俱乐部注册名称暂为深圳亚旅足球俱乐部。深足前队员范育红、李远平分别出任俱乐部总经理兼主教练、助理教练，前主教练路建人出任领队、守门员教练及新闻发言人，甲A时期的人气教练塔瓦雷斯回归出任技术顾问兼执行教练。足坛元老、前国家队主教练，同样亦是建队元老的曾雪麟亦重返深足，担任球队的总顾问。广东健力宝集团持有的深足10%股权成功转让，“健力宝”已完全退出深圳足球俱乐部。在第二回合广东德比中1比6大败使得范育红失去了帅位，另一前球员和教练谢峰回归上任，并被一度视为04年的冠军主帅朱广沪回归的前奏，但随着朱广沪转而加盟陕西浐灞而破灭。9月23日，深圳足球俱乐部由俱乐部股东发起成立的红钻公司冠名球队为深圳红钻足球队，并且成为第一支尝试实现自创品牌、自主经营、自我冠名的中国职业足球俱乐部。在主场对上海申花的比赛后，因错穿球衣事故而被中国足协倒扣联赛积分3分的极度不利情况下，球队在联赛最后10轮取得6胜4平的不败战绩，完成了保级。半程从上海申花租借来救驾的外援最佳射手埃尔南·巴尔克斯以17个进球（代表深圳队14场攻入14球）荣获2009赛季中超联赛金靴。
2010年，来自塞尔维亚的塞浦路斯前国脚射手，亦是前贝尔格莱德红星队主教练的高歌奇成为深足的主教练。崇尚进攻理念的高歌奇带领传统上以防守反击著称的深足在前四轮取得3胜1平，一度令人意外地跃至中超榜首。但从第五轮客场负于陕西浐灞开始，球队就陷入9轮不胜(3平6负)的尴尬。5月15日，深足俱乐部召开新闻发布会，宣布贵州茅台集团正式成为深圳队的主冠名商，贵州茅台保健酒业将买断深足胸前广告，并冠名赞助球队为期三年，赞助金额总计超过一亿元，球队冠名为深圳茅台红钻队。深足在经过一个“过山车”般的赛季后，在最后一轮方宣告保级成功，2010赛季深足最终排名第12位。半程加盟的新西兰国脚基伦以14场进8球成为队内最佳射手，日夫科维奇则以10个助攻荣获队内及中超助攻王。
2011年2月22日，外号“白巫师”的法国名帅特鲁西埃担任球队的主教练，合同期限为三年。他签下了卷诚一郎和乐山孝志两名日本球员，这也是中超联赛史上首次出现日本外援。因要让路大运会，深圳队要将大部分主场比赛迁到惠州和博罗体育中心进行,联赛上半程，全队2胜2平12负只拿到8分为球队降级埋下了伏笔。其中在惠州的最后一个主场比赛,深圳队战胜大连实德，是深圳队首次在主场联赛中击败大连实德，上一次深圳队在联赛击败大连实德是2002年甲A联赛的客场比赛。在大运会结束后，宝安体育场成为球队的新主场。但这个赛季球队仍在特鲁西埃过于激进的年轻化换血和战术改造下，尴尬地刷新了多项球队的队史记录——单一赛季中超积分最少（23分）、客场一场不胜(4平11负)、失球最多（53球）及输球场次最多（17场），在顶级联赛屹立14年后再度降级，同时深圳队也成为在职业化后首支从顶级联赛降级的前冠军球队 。
2012年，特鲁西埃以俱乐部划给的全权转会决策权和充足引援资金，在季前便引入11名新援，剑指冲超。深圳队在草皮良好的主场宝安体育场可打出精彩取胜的传控足球，却在客场屡屡受制于不适合地面推进的草皮状况，和自身缺乏变通的固执战术和及时的临场调动。在客场仅取得2胜2平，却有8场输球和连续7轮客场不胜后，深圳队早早基本失去了冲超机会。但新加盟的法国外援射手巴巴卡以23粒进球夺得中甲金靴，并打破此前李毅保持的队史单季进球纪录的。赛季结束后，俱乐部选择继续留用特鲁西埃，辞退了两位一度在赛季中后期代理带队的助理外教。
2013年，队长和后防中坚弋腾以高达一千万人民币的队史第一高价离队。开局四连主场，深足在雨后对弱旅湖北华凯尔率先失球后反超，险些开局便翻船，随后接连完败潜在的冲超对手广东日之泉和哈尔滨毅腾。直到第五轮赛季第一个客场，并且凭借张世昌的神勇表现从状态火热的北京八喜主场围攻中全取三分。取得深足在特鲁西埃近3年治下仅仅第4场客场胜利。 该场险胜成为了赛季首个分水岭，深足却以联赛6连胜打破了队史中的联赛连胜纪录（4连胜）。（期间另有一场主场足协杯赛入3球，总计为全部一队赛事7连胜）。 但在随后的一周长途客场双赛中先后失利，不过球队并未受太大影响再取三连胜，逐渐追近领头羊河南建业，不过在上半赛季最后一轮直接对话的榜首大战中客场遗憾小负。 尽管被河南建业击败甩开，但深足仍取得半程亚军的冲超有利位置。紧接而来连续四连客场中，深足遭遇不顺难保清白，净吞10球仅取1分，自此一落千丈后半程联赛客场全部九轮不胜仅得两个积分，再度滑落出冲超集团。赛季结束积分排名联赛仅第五。 2013赛季结束后主帅特鲁西埃也合约到期离任。随后俱乐部宣布了下赛季的新赞助商小牛资本，并由中方教练组中的李毅担任代理主教练，王宏伟担任助教，后均转为正式任命。
2014年，深足在世界杯休战期前半年尚且稳扎稳打，尽管俱乐部累积的拖欠薪水和奖金问题逐渐恶化，并深陷转让传闻中，但仍取得了中上排名并非全无冲超希望。但俱乐部的转让进程由于以往累积的股权乱局和万宏伟要求保留少部分股份的条件，从5月起就开展却难以成交，从而使得球员和俱乐部间的欠薪矛盾在随后以一种极端的形式爆发。 2014年7月15日，深圳红钻在主场深圳宝安体育场进行的中国足协杯第三轮赛事以0-5惨败山东鲁能，但是赛事焦点却集中在了深圳红钻队员赛前讨薪上。队员们赛前就因被欠薪而放弃本场比赛，经各方一番紧急沟通后，深足队员同意参赛，但球员仍以特殊方式表达对欠薪的不满。在本场比赛开始前，深足队员们举起上面写道“请求足协帮助，球员生活已无法维持，还我血汗钱”的横幅。在裁判吹响开赛哨后，深足队员们面向本方的球门默站了足足30秒，以示对俱乐部长期拖欠薪酬的***，事后迅速在全国引起热议。足协也立刻发出工作组到深圳调查并维稳，尽管作出了再不解决欠薪就会遭到扣分以及乃至明年不准予注册参赛的警告，但仍无助于解开俱乐部本身积重难返的结。在代表其中一家竞购方新到任的副总，亦是深足的老面孔孙刚和教练组的努力下，只能偶然收到俱乐部通过***等预支手段筹发的基本薪水的球员没有再出现通过集体罢训罢赛***的情况，但球队在时常遭遇外援因欠薪拒绝出赛的困难上难保成绩理想，不过仍实现了提前保级并尽量攒分以预防足协可能作出的扣分出发，最终以第十名结束了一个场上偶有亮点，场下却行走于解散边缘的困难赛季。
2014年12月19日，俱乐部召开记者招待会宣布深圳兆能源酒店供应股份有限公司通过注资的方式获得俱乐部55%的股权并成为新控股方。同时，俱乐部名称改为中性的深圳市足球俱乐部。
